結論から言うと賃金の補助はしないほうがいいです。

傷病手当金はお給料（厳密には標準報酬）の3分の2を支給されます。
ところが賃金を補助するとその分傷病手当金から以下のように減額されてしまいます。

つまり
傷病手当金−賃金額＝支給額　になります。

会社・従業員双方にとってメリットがないからです。

給料全額補償したい場合は、本人の同意が前提になりますが、傷病手当金の申請は行わず有給休暇を充当するのがいいでしょう。有給休暇を消化したあとでも申請はできます。

また休職期間中も社会保険料の負担は会社・被保険者とも発生しますのでご注意ください。